かつて大いなる危機より地球を守り抜いた若者たち――『バトルラヴァーズ』と『カルルス騎士団ハッピーキッス』。そして今、再び訪れる危機を前に眉難高校『地球防衛部』は新たなヒーローに変身する！ ……え？ 今度の舞台は大正時代だから時系列的にこっちの方が古いんじゃないかって？ そんな些細なことは気にせず、新たな（強調）防衛部の面々――雲仙新九郎、卯花惣輔、酸ヶ湯愛琉志、長万部潮、阿蘇空太をよろしく！

謎の未来猫ヌルさんの猫科学で、『ハイカラ浪漫団』となり地球征服を目論む怪人をみごとに撃破した防衛部の5人。そんな彼らの前に現れたのは、謎のプレーリードッグことマスター・キャンに導かれし地球征服部、『蛮華羅新鋭隊』。その正体はなんと、黒玉寮の同居人にして眉難高校生徒會――百目鬼珠闘麗斗、乳頭左門、猫魔祐の三人であった。敵と味方が一つ屋根の下、これで何も起きないはずがなく……？（特に起きない）

月に一度の恒例行事、眉難高校美男子コンテスト。入学以来連続優勝記録を伸ばし続けている酸ヶ湯愛琉志は、まさに自他共に認める美しさのカリスマ。そして美しさにこだわる酸ヶ湯は、様々なアプローチで連覇を狙っていた。それはメディア戦略の先駆けとも言える画期的な作戦であった。だが、大正生まれの酸ヶ湯は知らなかった。その手法が光だけでなく闇の一面も持つことを……。今、眉難高校が燃え上がる！

御殿場寮長倒れる！ 親元を離れて暮らす寮生たちにとって、大黒柱たる寮長の不在はまさに生活の危機。だが、そんな時にこそ立ち上がるのが卯花惣輔という男。その家事スキルはまたたくまに寮生たちに安堵をもたらすも、卯花の母性が暴走し、防衛部を目の敵にする生徒會たちですらまとめて飲み込んでしまう。少年たちは浸食してくる母性に抗い親離れするのか？ 流されるがママ受け入れるのか？ 母だけに！

眉難市に夏到来！ 男乱（だんらん）海岸で眉難高校伝統の遠泳大会が開かれることになり、防衛部や生徒たちも活気づく。その中で、もっともこのイベントに打ち込んでいるのは生徒会長の百目鬼珠闘麗斗。地球征服もひとまず忘れ遠泳大会優勝に賭けるその情熱には、何やら雲仙新九郎との過去からつながる因縁があるようで……。そして激突する百目鬼と雲仙。勝利の鍵を握るのは……赤フン？

眉難高校は夏休みに突入し、阿蘇空太は山の幸で釣った食いしん坊の長万部を連れて里帰り。故郷の村で二人を待っていたのは、阿蘇の三人の弟たち。防衛部では末っ子扱いの阿蘇も故郷では立派なお兄ちゃんっぷりを見せつけるが、次男のとん太だけはなぜか阿蘇に反発。兄弟ゲンカで飛び出したところを、たまたま近くに避暑に来ていた征服部に怪人にされてしまう！ 兄弟の絆の行く末は？ そして雲仙たちの出番は？

長万部潮は思い悩んでいた。今時大食いというのはありふれた特徴でしかなく無個性なのではないか、と。そして悩んでいた阿蘇はヌルさんと共に海の中へと消え……蟹工船に乗ることになった！ 休む間もなく蟹を穫り、蟹を加工する過酷な労働の日々の中、長万部の空腹はついに限界に達して……！ 防衛部と征服部もまた動き出し、蟹工船に全ての役者が揃い、そして舞台の幕はあがる。