惑星まるごとひとつをテーマパークにした人気スポット「ワールズ・ワールド」。そこを管理するコンピュータ・シリカ2000が、正体不明のウィルスに感染。WWWAは、有能なコンピュータ専門のトラブルコンサルタント・トーマと、護衛としてケイとユリを派遣する。だが、到着して早々トーマは命を狙われるようになり…。

暗殺者との戦いで、ケイたちの宿泊するホテルは吹き飛んでしまった。仕方なく3人は短期留学生として学生寮に宿泊することになる。だが、その学生寮は壁にお札が貼ってあったり、風呂場の鏡に死体のようなものが映ったりと異様な雰囲気。そんな中、2人は1年生の風祭久美から、学生寮に出る幽霊退治を頼まれる。

食事に行ったバイキングで、トラブルコンサルタントだと称した男が女性を口説いている場面に遭遇したケイたち。だが、男の持っている身分証は真っ赤な偽物。男の正体は手配中の詐欺師、ガルディだったのだ。手配犯を逮捕した時の報奨金を狙い、ケイとユリはヘリで逃走しようとするガルディに飛びかかるのだが…。

コンピュータオタクのトーマが、花屋の店員の女性・リーナに恋をした。しかし、恋愛経験のないトーマは、リーナの情報をハッキングで調べたり、人工衛星で隠し撮りをしたりと、変質者のようなことばかりしている始末。業を煮やしたユリは、リーナに電話をかけて会う約束を取り付け、有頂天になるトーマだったが…。

宇宙港の閉鎖が解けたある日、トーマは再び命を狙われた。犯人は、シリカ2000にウィルスを感染させた実行犯でもある人工知能のジェイク。潜伏先の工場のコンピュータを抜け出したジェイクは、自分のプログラムをコピーしたアンドロイドを宇宙船に乗せて逃亡を図る。それに気付いた3人は、ナリタ宇宙港に向かって…。